.github/CODEOWNERS
LICENSE
Project.toml
coverage/Project.toml
coverage/coverage.jl
docs/Project.toml
docs/make.jl
src/ReadDatastores.jl
src/linked-reads.jl
src/long-reads.jl
src/paired-reads.jl
src/sequence-buffer.jl
src/short-reads.jl
sticker.svg
test/10x_tester_R1.fastq
test/10x_tester_R2.fastq
test/10xtest-old.lrseq
test/ecoli-paired-old.prseq
test/ecoli_tester_R1.fastq
test/ecoli_tester_R2.fastq
test/human-nanopore-old.loseq
test/human_nanopore_tester_2D.fastq
test/linked-reads.jl
test/long-reads.jl
test/paired-reads.jl
test/runtests.jl
<<<<<< network
# path=./lcov.info
SF:src\ReadDatastores.jl
DA:1,10
DA:38,6
DA:42,6
DA:43,6
DA:47,0
DA:48,0
DA:49,0
DA:50,0
DA:54,10
DA:55,10
DA:56,10
DA:57,10
DA:69,2
DA:73,2
DA:74,1
DA:75,1
DA:76,1
DA:80,2
DA:85,2
DA:86,1
DA:87,1
DA:88,1
DA:89,0
DA:90,1
DA:91,1
DA:92,0
DA:93,0
DA:95,0
DA:97,1
DA:98,1
DA:102,9
DA:106,8
DA:111,2
DA:112,1
DA:113,1
DA:114,1
DA:115,1
DA:116,1
DA:120,40
DA:121,20
DA:122,20
DA:124,20
DA:125,0
DA:128,20
DA:129,0
DA:132,20
DA:133,3
DA:136,17
DA:138,17
DA:139,3
DA:153,2
DA:154,1
DA:155,1
DA:156,1
DA:157,1
DA:161,2
DA:162,1
DA:163,1
DA:164,1
DA:165,1
DA:169,2
DA:170,1
DA:171,1
DA:172,1
DA:173,1
DA:179,48
DA:186,4
DA:189,1215
DA:191,2
DA:192,37
DA:193,4
DA:194,2
DA:195,2
DA:196,0
DA:197,3
DA:200,25
DA:201,16
DA:203,9
DA:207,0
DA:208,0
DA:210,0
DA:215,6
DA:216,3
DA:217,3
DA:219,3
DA:244,2368
DA:245,1184
DA:246,1184
DA:250,12
DA:251,12
DA:252,6
DA:253,6
DA:254,6
DA:255,6
DA:256,6
DA:257,6
DA:259,2
DA:260,0
DA:262,2
DA:263,4
DA:264,2
DA:265,2
DA:266,2
DA:267,2
DA:268,2
DA:270,0
DA:272,6
DA:327,0
DA:336,0
LH:91
LF:109
end_of_record
SF:src\linked-reads.jl
DA:3,2
DA:4,2
DA:18,0
DA:19,0
DA:24,400
DA:26,200
DA:27,2936
DA:28,5380
DA:29,2690
DA:30,768
DA:31,1984
DA:32,658
DA:33,1326
DA:34,606
DA:35,720
DA:37,5180
DA:40,234
DA:41,200
DA:42,200
DA:43,200
DA:44,200
DA:48,6
DA:58,6
DA:59,6
DA:112,2
DA:116,2
DA:117,2
DA:119,4
DA:121,2
DA:122,2
DA:123,2
DA:124,2
DA:126,20
DA:129,218
DA:130,202
DA:131,202
DA:132,202
DA:134,2
DA:135,2
DA:137,0
DA:139,200
DA:140,200
DA:141,200
DA:142,166
DA:146,18
DA:148,18
DA:149,36
DA:150,36
DA:151,166
DA:152,166
DA:153,166
DA:154,166
DA:155,166
DA:156,314
DA:158,18
DA:159,18
DA:160,36
DA:161,18
DA:162,18
DA:164,2
DA:165,2
DA:166,4
DA:168,4
DA:169,2
DA:170,4
DA:173,2
DA:175,2
DA:177,2
DA:179,4
DA:181,2
DA:182,2
DA:185,2
DA:186,2
DA:187,2
DA:188,4
DA:189,34
DA:192,2
DA:193,2
DA:194,168
DA:195,332
DA:197,332
DA:198,1494
DA:199,1660
DA:201,166
DA:202,166
DA:203,166
DA:204,166
DA:205,18
DA:206,18
DA:207,36
DA:209,314
DA:215,4
DA:216,2
DA:217,4
DA:218,2
DA:219,2
DA:220,2
DA:221,2
DA:222,20
DA:224,2
DA:225,20
DA:227,4
DA:228,2
DA:232,21
DA:234,6
DA:236,4
DA:237,4
DA:238,4
DA:240,4
DA:242,4
DA:245,0
DA:246,6
DA:247,2
DA:249,9
DA:251,1
DA:253,0
DA:261,0
DA:262,0
LH:111
LF:118
end_of_record
SF:src\long-reads.jl
DA:2,20
DA:6,4
DA:9,8
DA:16,8
DA:20,0
DA:21,0
DA:22,0
DA:23,0
DA:24,0
DA:27,0
DA:32,8
DA:33,8
DA:82,2
DA:85,2
DA:87,2
DA:88,2
DA:92,2
DA:94,2
DA:96,2
DA:97,2
DA:99,4
DA:101,4
DA:103,22
DA:104,22
DA:105,24
DA:107,2
DA:108,2
DA:110,0
DA:112,20
DA:113,20
DA:114,0
DA:115,0
DA:117,20
DA:118,20
DA:119,20
DA:120,20
DA:121,40
DA:124,4
DA:125,4
DA:127,2
DA:129,4
DA:131,2
DA:134,2
DA:135,2
DA:136,2
DA:138,4
DA:140,2
DA:141,2
DA:145,26
DA:147,8
DA:149,6
DA:150,6
DA:151,6
DA:152,6
DA:153,6
DA:160,28
DA:162,2
DA:165,2
DA:168,8
DA:171,4
DA:172,4
DA:173,4
DA:177,2
DA:178,2
DA:182,2
DA:183,2
DA:187,2
DA:188,2
DA:189,2
DA:190,2
LH:61
LF:70
end_of_record
SF:src\paired-reads.jl
DA:4,6
DA:17,2
DA:40,6
DA:41,6
DA:98,2
DA:108,4
DA:109,2
DA:110,2
DA:111,2
DA:114,2
DA:117,2
DA:120,2
DA:126,2
DA:131,4
DA:132,4
DA:134,22
DA:136,22
DA:137,22
DA:138,22
DA:140,2
DA:141,2
DA:143,0
DA:146,20
DA:147,20
DA:149,40
DA:150,0
DA:151,0
DA:154,20
DA:155,0
DA:156,0
DA:161,20
DA:162,16
DA:163,16
DA:168,20
DA:172,20
DA:173,20
DA:178,20
DA:179,20
DA:181,20
DA:182,40
DA:185,2
DA:187,2
DA:188,2
DA:189,2
DA:190,2
DA:192,4
DA:193,4
DA:194,4
DA:195,4
DA:197,2
DA:198,2
DA:203,20
DA:205,6
DA:207,4
DA:209,4
DA:210,4
DA:211,4
DA:212,4
DA:213,4
DA:214,4
DA:216,4
DA:221,28
DA:223,2
DA:225,8
DA:226,26
DA:227,4
LH:61
LF:66
end_of_record
SF:src\sequence-buffer.jl
DA:3,0
DA:4,0
DA:6,0
DA:7,0
DA:10,14
DA:16,10
DA:20,16
DA:21,6
DA:23,10
DA:26,8
DA:27,12
DA:28,8
DA:29,25
DA:30,16
DA:31,12
DA:33,0
DA:34,0
DA:35,0
DA:36,6
DA:37,2
DA:38,0
DA:39,0
DA:40,14
DA:43,4
DA:44,8
DA:45,8
DA:46,16
DA:47,938
DA:48,1868
DA:51,8
DA:59,0
DA:60,4
DA:61,4
DA:62,4
DA:63,4
DA:64,4
DA:65,4
DA:70,9
DA:71,2
DA:72,2
DA:74,2
DA:75,2
DA:76,2
DA:77,2
DA:79,29
DA:83,2
DA:84,2
DA:86,2
DA:87,2
DA:88,2
DA:89,2
DA:91,29
DA:99,4
DA:100,4
DA:101,4
DA:102,4
DA:103,0
DA:104,0
DA:107,4
DA:108,4
DA:109,4
DA:110,4
DA:111,4
DA:112,4
DA:117,2
DA:118,2
DA:119,2
DA:120,2
DA:121,440
DA:125,2
DA:126,2
DA:127,2
DA:128,2
DA:129,2
DA:130,440
DA:134,4
DA:135,469
DA:139,0
DA:140,0
DA:142,0
DA:146,0
DA:148,0
LH:65
LF:82
end_of_record
SF:src\short-reads.jl
DA:3,0
DA:5,8
DA:8,4
DA:9,4
DA:10,4
DA:11,4
DA:12,4
DA:16,9
DA:17,2
DA:21,9
DA:22,2
DA:23,2
DA:27,3
LH:12
LF:13
end_of_record
<<<<<< EOF