LICENSE Project.toml docs/Project.toml docs/make.jl src/FASTX.jl src/fasta/fasta.jl src/fasta/index.jl src/fasta/reader.jl src/fasta/readrecord.jl src/fasta/record.jl src/fasta/writer.jl src/fastq/fastq.jl src/fastq/fastqread.jl src/fastq/quality.jl src/fastq/reader.jl src/fastq/readrecord.jl src/fastq/record.jl src/fastq/writer.jl sticker.svg test/runtests.jl <<<<<< network # path=./lcov.info SF:src\fasta\fasta.jl LH:0 LF:0 end_of_record SF:src\fasta\index.jl DA:12,1 DA:20,0 DA:24,2 DA:29,1 DA:30,4 DA:32,4 DA:33,4 DA:34,4 DA:35,4 DA:36,4 DA:40,4 DA:42,1 DA:46,18 DA:47,6 DA:48,2 DA:49,10 DA:50,1 DA:54,4 DA:55,4 DA:56,4 DA:57,4 DA:63,5 DA:69,10 DA:70,4 DA:71,1 DA:86,4 DA:87,4 LH:26 LF:27 end_of_record SF:src\fasta\reader.jl DA:5,191 DA:19,476 DA:20,1 DA:22,1 DA:26,239 DA:33,47 DA:37,0 DA:41,1185 DA:45,1183 DA:46,189 DA:47,0 DA:49,994 DA:53,49 DA:56,49 DA:60,10 DA:61,0 DA:64,5 DA:69,4 DA:70,4 DA:71,4 DA:81,2 DA:82,2 DA:83,1 DA:85,1 DA:88,2 DA:89,2 DA:90,1 DA:91,2 DA:92,2 DA:100,6 DA:101,2 DA:104,2 DA:106,1 DA:111,30 DA:112,60 DA:113,0 DA:115,30 DA:119,90 DA:120,0 DA:121,0 DA:124,30 LH:35 LF:41 end_of_record SF:src\fasta\readrecord.jl DA:39,16620 DA:58,1028 DA:65,16620 DA:66,16620 DA:67,16620 DA:68,1028 DA:83,36324 DA:86,1028 DA:87,18676 DA:99,153774 DA:100,0 DA:102,153774 LH:11 LF:12 end_of_record SF:src\fasta\record.jl DA:6,1070 DA:20,12 DA:38,30 DA:48,4 DA:50,0 DA:58,28 DA:67,56 DA:68,28 DA:69,13 DA:70,13 DA:73,28 DA:74,56 DA:78,1238 DA:81,819 DA:83,3 DA:88,794 DA:97,198 DA:101,0 DA:102,0 DA:106,0 DA:107,0 DA:108,0 DA:109,0 DA:110,0 DA:111,0 DA:113,0 DA:118,0 DA:119,0 DA:121,0 DA:126,0 DA:127,0 DA:128,0 DA:129,0 DA:130,0 DA:134,6 DA:138,408 DA:154,32 DA:155,62 DA:156,0 DA:158,31 DA:167,71 DA:171,2 DA:175,2 DA:187,26 DA:188,50 DA:189,12 DA:191,13 DA:200,460 DA:209,4 DA:212,2 DA:229,32 DA:231,32 DA:235,4 DA:236,2 DA:254,69 DA:255,32 DA:256,32 DA:266,2 DA:270,4 DA:273,0 DA:274,0 DA:286,5 DA:297,2 DA:298,0 DA:302,2 DA:303,2 DA:307,0 DA:311,0 DA:315,2 DA:319,528 DA:320,4 DA:327,32 DA:328,32 DA:330,776 DA:331,66 DA:332,644 DA:333,78 DA:334,488 DA:335,51 DA:336,386 DA:337,81 DA:338,224 DA:339,0 DA:340,224 DA:343,1164 DA:345,387 DA:347,388 DA:353,64 DA:354,28 DA:355,28 DA:357,0 DA:360,4 DA:365,110 LH:67 LF:93 end_of_record SF:src\fasta\writer.jl DA:14,97 DA:20,0 DA:26,98 DA:29,1 DA:33,97 DA:38,400 DA:41,400 DA:42,396 DA:44,464 DA:45,202 DA:46,202 DA:49,8586 DA:51,4091 DA:52,4091 DA:53,4091 DA:56,400 LH:15 LF:16 end_of_record SF:src\fastq\fastq.jl LH:0 LF:0 end_of_record SF:src\fastq\fastqread.jl DA:7,5 DA:25,7 DA:34,5 DA:47,2 DA:55,2 DA:63,2 DA:71,12 DA:80,2 DA:84,2 DA:89,1 LH:10 LF:10 end_of_record SF:src\fastq\quality.jl DA:17,0 DA:18,0 DA:20,0 DA:26,0 DA:47,6 DA:48,6 DA:50,705 DA:51,236 DA:58,8 DA:60,8 DA:61,266 DA:63,8 DA:68,5 DA:70,5 DA:71,33 DA:73,5 LH:12 LF:16 end_of_record SF:src\fastq\reader.jl DA:5,148 DA:19,174 DA:22,4 DA:26,148 DA:33,82 DA:37,0 DA:41,1803 DA:45,583 DA:46,124 DA:47,4 DA:49,459 DA:53,120 DA:56,60 DA:60,8 DA:62,4 DA:63,8 DA:64,4 DA:65,96 DA:66,48 DA:69,4 DA:75,38 DA:76,76 DA:77,0 DA:79,38 DA:83,114 DA:84,0 DA:85,0 DA:88,38 LH:24 LF:28 end_of_record SF:src\fastq\readrecord.jl DA:2,0 DA:4,0 DA:6,0 DA:8,0 DA:9,0 DA:10,0 DA:11,0 DA:13,0 DA:14,0 DA:15,0 DA:17,0 DA:20,0 DA:21,0 DA:22,0 DA:24,0 DA:25,0 DA:26,0 DA:27,0 DA:29,0 DA:30,0 DA:32,0 DA:33,0 DA:34,0 DA:36,0 DA:37,0 DA:38,0 DA:39,0 DA:42,0 DA:43,0 DA:45,0 DA:46,0 DA:47,0 DA:49,0 DA:51,0 DA:58,1008 DA:62,504 DA:66,154 DA:67,77 DA:68,154 DA:82,504 DA:98,644 DA:99,12 DA:100,1135 DA:101,5 DA:102,1125 DA:105,231 DA:106,1 DA:108,550 DA:109,4 DA:111,626 LH:16 LF:50 end_of_record SF:src\fastq\record.jl DA:6,549 DA:21,72 DA:39,38 DA:50,8 DA:53,0 DA:61,78 DA:70,128 DA:71,1 DA:73,34 DA:74,34 DA:75,15 DA:76,15 DA:79,34 DA:82,34 DA:83,68 DA:87,53 DA:90,29 DA:92,3 DA:97,358 DA:107,0 DA:111,0 DA:112,0 DA:116,0 DA:117,0 DA:118,0 DA:119,0 DA:120,0 DA:121,0 DA:122,0 DA:124,0 DA:129,0 DA:130,0 DA:131,0 DA:132,0 DA:133,0 DA:134,0 DA:138,6 DA:142,13 DA:158,227 DA:159,227 DA:160,0 DA:162,227 DA:171,2 DA:184,28 DA:185,56 DA:188,28 DA:197,272 DA:201,0 DA:202,0 DA:211,2 DA:214,1 DA:226,4 DA:236,2 DA:237,1 DA:238,0 DA:240,1 DA:257,236 DA:259,232 DA:269,3 DA:270,1 DA:284,465 DA:297,2 DA:301,2 DA:309,449 DA:311,224 DA:313,31038 DA:315,224 DA:329,17 DA:330,16 DA:338,6 DA:340,6 DA:341,3 DA:343,3 DA:352,2 DA:356,2 DA:360,2 DA:364,2 DA:368,0 DA:372,2 DA:376,144 DA:385,823 DA:386,1 LH:59 LF:82 end_of_record SF:src\fastq\writer.jl DA:5,32 DA:10,0 DA:13,94 DA:28,32 DA:33,103 DA:37,103 DA:39,103 DA:40,84 DA:43,103 DA:45,103 DA:47,103 DA:48,103 DA:50,2 DA:51,1 DA:55,103 DA:57,103 DA:58,103 LH:16 LF:17 end_of_record SF:src\FASTX.jl LH:0 LF:0 end_of_record <<<<<< EOF