LICENSE
Project.toml
docs/Project.toml
docs/make.jl
src/FASTX.jl
src/fasta/fasta.jl
src/fasta/index.jl
src/fasta/reader.jl
src/fasta/readrecord.jl
src/fasta/record.jl
src/fasta/writer.jl
src/fastq/fastq.jl
src/fastq/fastqread.jl
src/fastq/quality.jl
src/fastq/reader.jl
src/fastq/readrecord.jl
src/fastq/record.jl
src/fastq/writer.jl
sticker.svg
test/runtests.jl
<<<<<< network
# path=./lcov.info
SF:src/FASTX.jl
DA:1,2
LH:1
LF:1
end_of_record
SF:src/fasta/fasta.jl
DA:4,6
LH:1
LF:1
end_of_record
SF:src/fasta/index.jl
DA:12,1
DA:20,1
DA:23,1
DA:24,1
DA:25,1
DA:26,1
DA:27,1
DA:28,1
DA:29,2
DA:30,4
DA:31,4
DA:32,4
DA:33,4
DA:34,4
DA:35,4
DA:36,4
DA:37,4
DA:38,4
DA:39,4
DA:40,7
DA:42,1
DA:45,6
DA:46,11
DA:47,6
DA:48,1
DA:49,5
DA:50,1
DA:54,4
DA:55,4
DA:56,4
DA:57,4
DA:59,4
DA:60,4
DA:61,4
DA:63,5
DA:68,5
DA:69,5
DA:70,4
DA:71,1
DA:75,3
DA:76,3
DA:77,3
DA:78,3
DA:82,3
DA:83,3
DA:84,3
DA:86,4
DA:87,4
LH:48
LF:48
end_of_record
SF:src/fasta/reader.jl
DA:5,476
DA:18,50
DA:19,478
DA:20,1
DA:21,238
DA:22,1
DA:24,238
DA:25,238
DA:26,238
DA:28,0
DA:33,284
DA:37,245
DA:40,2
DA:41,1183
DA:42,1183
DA:43,1183
DA:44,1183
DA:45,1183
DA:46,189
DA:47,0
DA:49,994
DA:53,49
DA:54,49
DA:56,49
DA:59,5
DA:60,10
DA:61,0
DA:64,5
DA:68,4
DA:69,4
DA:70,4
DA:71,4
DA:80,2
DA:81,2
DA:82,3
DA:83,1
DA:85,1
DA:88,2
DA:89,2
DA:90,1
DA:91,2
DA:92,2
DA:93,1
DA:94,1
DA:95,1
DA:98,1
DA:99,1
DA:100,3
DA:101,2
DA:102,2
DA:103,2
DA:104,2
DA:106,1
DA:110,30
DA:111,30
DA:112,60
DA:113,0
DA:115,30
DA:118,30
DA:119,60
DA:120,0
DA:121,0
DA:124,30
LH:57
LF:63
end_of_record
SF:src/fasta/readrecord.jl
DA:4,1
DA:5,1
DA:7,0
DA:9,0
DA:11,1
DA:12,1
DA:13,1
DA:15,1
DA:16,1
DA:17,1
DA:19,1
DA:20,1
DA:21,1
DA:24,0
DA:25,1
DA:26,1
DA:28,0
DA:29,0
DA:30,1
DA:31,1
DA:34,1
DA:36,1
DA:37,1
DA:39,33241
DA:40,1
DA:42,1
DA:44,1
DA:57,1028
DA:58,1028
DA:59,1028
DA:60,1028
DA:61,1028
DA:65,16620
DA:66,16620
DA:67,16620
DA:68,1028
DA:70,15592
DA:72,16620
DA:76,1028
DA:77,1028
DA:78,760
DA:82,18676
DA:83,18676
DA:84,13644
DA:86,18676
DA:87,18676
DA:91,1217
DA:92,1217
DA:93,1217
DA:94,1217
DA:95,1217
DA:99,153786
DA:100,0
DA:102,153786
LH:48
LF:54
end_of_record
SF:src/fasta/record.jl
DA:6,1070
DA:19,6
DA:20,246
DA:36,30
DA:37,60
DA:38,30
DA:48,2
DA:50,0
DA:57,13
DA:58,15
DA:66,28
DA:67,28
DA:68,28
DA:69,28
DA:70,13
DA:72,28
DA:73,28
DA:74,28
DA:77,413
DA:78,413
DA:79,411
DA:80,411
DA:81,411
DA:83,2
DA:87,794
DA:88,794
DA:97,198
DA:100,0
DA:101,0
DA:102,0
DA:105,0
DA:106,0
DA:107,0
DA:108,0
DA:109,0
DA:110,0
DA:111,0
DA:113,0
DA:117,0
DA:118,0
DA:119,0
DA:121,0
DA:126,1217
DA:127,1217
DA:128,1217
DA:129,1217
DA:130,1217
DA:133,3
DA:134,1641
DA:138,408
DA:153,34
DA:154,34
DA:155,33
DA:156,0
DA:158,33
DA:166,1
DA:167,37
DA:170,1
DA:171,1
DA:174,1
DA:175,1
DA:186,28
DA:187,28
DA:188,27
DA:189,13
DA:191,14
DA:199,2
DA:200,231
DA:208,2
DA:209,2
DA:210,2
DA:211,2
DA:212,2
DA:228,34
DA:229,34
DA:230,34
DA:231,34
DA:234,3
DA:235,3
DA:236,2
DA:253,40
DA:254,68
DA:255,34
DA:256,34
DA:264,1
DA:266,4
DA:270,5
DA:272,0
DA:273,0
DA:274,0
DA:285,3
DA:286,3
DA:296,3
DA:297,2
DA:298,0
DA:302,2
DA:303,2
DA:306,0
DA:307,0
DA:310,0
DA:311,0
DA:314,1
DA:315,1
DA:319,536
DA:320,4
DA:325,34
DA:327,34
DA:328,68
DA:329,396
DA:330,724
DA:331,68
DA:332,576
DA:333,80
DA:334,443
DA:335,53
DA:336,307
DA:337,83
DA:338,224
DA:339,0
DA:340,217
DA:341,7
DA:343,397
DA:344,395
DA:345,395
DA:347,396
DA:353,34
DA:354,30
DA:355,30
DA:357,0
DA:360,4
DA:364,24
DA:365,24
LH:105
LF:132
end_of_record
SF:src/fasta/writer.jl
DA:14,97
DA:20,97
DA:26,192
DA:28,1
DA:29,97
DA:30,0
DA:32,97
DA:33,97
DA:37,400
DA:38,400
DA:39,400
DA:40,400
DA:41,400
DA:42,198
DA:44,344
DA:45,202
DA:46,202
DA:47,202
DA:48,202
DA:49,4293
DA:50,4091
DA:51,4091
DA:52,4091
DA:53,4091
DA:56,400
LH:24
LF:25
end_of_record
SF:src/fastq/fastq.jl
DA:1,7
LH:1
LF:1
end_of_record
SF:src/fastq/fastqread.jl
DA:7,10
DA:24,2
DA:25,2
DA:33,1
DA:34,1
DA:46,1
DA:47,1
DA:54,1
DA:55,2
DA:62,1
DA:63,1
DA:70,3
DA:71,3
DA:79,1
DA:80,1
DA:83,1
DA:84,1
DA:85,1
DA:86,1
DA:87,1
DA:88,1
DA:89,1
LH:22
LF:22
end_of_record
SF:src/fastq/quality.jl
DA:16,5
DA:17,10
DA:18,0
DA:20,5
DA:26,13
DA:46,6
DA:47,6
DA:48,12
DA:49,236
DA:50,236
DA:51,3
DA:57,8
DA:58,16
DA:59,8
DA:60,16
DA:61,524
DA:63,8
DA:67,5
DA:68,10
DA:69,5
DA:70,10
DA:71,61
DA:73,5
LH:22
LF:23
end_of_record
SF:src/fastq/reader.jl
DA:5,296
DA:18,36
DA:19,296
DA:20,144
DA:22,4
DA:24,148
DA:25,148
DA:26,148
DA:28,0
DA:33,199
DA:37,1
DA:40,601
DA:41,605
DA:42,583
DA:43,583
DA:44,583
DA:45,583
DA:46,124
DA:47,4
DA:49,459
DA:52,60
DA:53,60
DA:54,60
DA:56,60
DA:59,4
DA:60,4
DA:62,8
DA:63,4
DA:64,8
DA:65,288
DA:66,60
DA:69,4
DA:74,38
DA:75,38
DA:76,76
DA:77,0
DA:79,38
DA:82,38
DA:83,76
DA:84,0
DA:85,0
DA:88,38
LH:38
LF:42
end_of_record
SF:src/fastq/readrecord.jl
DA:1,1
DA:2,1
DA:4,0
DA:6,0
DA:8,0
DA:9,1
DA:10,1
DA:11,1
DA:13,1
DA:14,1
DA:15,1
DA:17,1
DA:20,0
DA:21,1
DA:22,1
DA:24,0
DA:25,1
DA:26,1
DA:27,1
DA:29,1
DA:30,1
DA:32,0
DA:33,1
DA:34,1
DA:36,0
DA:37,0
DA:38,1
DA:39,1
DA:42,1
DA:43,2
DA:45,1
DA:46,1
DA:47,1
DA:49,1
DA:51,1
DA:57,504
DA:58,504
DA:59,195
DA:61,504
DA:62,504
DA:65,77
DA:66,77
DA:67,77
DA:68,77
DA:82,504
DA:83,504
DA:84,504
DA:89,639
DA:90,639
DA:91,639
DA:92,639
DA:93,639
DA:94,639
DA:98,644
DA:99,12
DA:100,632
DA:101,5
DA:102,627
DA:103,77
DA:104,77
DA:105,154
DA:106,1
DA:108,550
DA:109,4
DA:111,626
LH:57
LF:65
end_of_record
SF:src/fastq/record.jl
DA:6,549
DA:20,36
DA:21,153
DA:37,38
DA:38,76
DA:39,38
DA:49,4
DA:50,4
DA:53,0
DA:60,20
DA:61,40
DA:69,50
DA:70,70
DA:71,1
DA:73,34
DA:74,34
DA:75,34
DA:76,15
DA:78,34
DA:79,34
DA:80,34
DA:81,68
DA:82,34
DA:83,34
DA:86,18
DA:87,18
DA:88,16
DA:89,16
DA:90,16
DA:92,2
DA:96,358
DA:97,358
DA:106,0
DA:107,0
DA:110,0
DA:111,0
DA:112,0
DA:115,0
DA:116,0
DA:117,0
DA:118,0
DA:119,0
DA:120,0
DA:121,0
DA:122,0
DA:124,0
DA:129,639
DA:130,639
DA:131,639
DA:132,639
DA:133,639
DA:134,639
DA:137,3
DA:138,1247
DA:142,13
DA:157,229
DA:158,229
DA:159,229
DA:160,0
DA:162,229
DA:170,1
DA:171,232
DA:183,30
DA:184,30
DA:185,46
DA:186,14
DA:188,30
DA:196,2
DA:197,238
DA:200,0
DA:201,0
DA:202,0
DA:210,1
DA:211,1
DA:212,1
DA:213,1
DA:214,1
DA:225,2
DA:226,2
DA:235,2
DA:236,2
DA:237,1
DA:238,0
DA:240,1
DA:256,236
DA:257,236
DA:258,234
DA:259,234
DA:268,2
DA:269,2
DA:270,1
DA:283,5
DA:284,464
DA:295,1
DA:297,3
DA:301,3
DA:308,227
DA:309,452
DA:310,226
DA:311,450
DA:313,61872
DA:315,226
DA:328,11
DA:329,12
DA:330,10
DA:337,6
DA:338,6
DA:339,6
DA:340,6
DA:341,3
DA:343,3
DA:351,1
DA:352,1
DA:355,1
DA:356,1
DA:359,1
DA:360,1
DA:363,1
DA:364,1
DA:367,0
DA:368,0
DA:371,1
DA:372,1
DA:375,26
DA:376,26
DA:385,831
DA:386,1
LH:105
LF:127
end_of_record
SF:src/fastq/writer.jl
DA:5,32
DA:10,32
DA:13,64
DA:24,32
DA:25,0
DA:27,32
DA:28,32
DA:32,103
DA:33,103
DA:34,103
DA:35,103
DA:37,103
DA:38,103
DA:39,187
DA:40,84
DA:41,84
DA:43,103
DA:44,103
DA:45,103
DA:47,103
DA:48,103
DA:49,2
DA:50,3
DA:51,1
DA:52,1
DA:55,103
DA:56,103
DA:57,103
DA:58,103
LH:28
LF:29
end_of_record
<<<<<< EOF