LICENSE Project.toml docs/Project.toml docs/make.jl src/BioSequences.jl src/alphabet.jl src/biosequence/biosequence.jl src/biosequence/conversion.jl src/biosequence/counting.jl src/biosequence/find.jl src/biosequence/indexing.jl src/biosequence/predicates.jl src/biosequence/printing.jl src/biosequence/transformations.jl src/bit-manipulation/bit-manipulation.jl src/bit-manipulation/bitindex.jl src/bit-manipulation/bitpar-compiler.jl src/composition.jl src/demultiplexer.jl src/geneticcode.jl src/iterators/condition.jl src/iterators/eachmer.jl src/iterators/skipmerfactory.jl src/longsequences/constructors.jl src/longsequences/conversion.jl src/longsequences/copying.jl src/longsequences/counting.jl src/longsequences/hash.jl src/longsequences/indexing.jl src/longsequences/longsequence.jl src/longsequences/operators.jl src/longsequences/printing.jl src/longsequences/randseq.jl src/longsequences/stringliterals.jl src/longsequences/transformations.jl src/mers/conversion.jl src/mers/counting.jl src/mers/indexing.jl src/mers/mer.jl src/mers/predicates.jl src/mers/transformations.jl src/minhash.jl src/nmask.jl src/refseq/refseq.jl src/search/approx.jl src/search/exact.jl src/search/pwm.jl src/search/re.jl sticker.svg test/composition.jl test/counting.jl test/demultiplexer.jl test/iterators/condition.jl test/iterators/eachmer.jl test/longsequences/basics.jl test/longsequences/conversion.jl test/longsequences/find.jl test/longsequences/hashing.jl test/longsequences/iteration.jl test/longsequences/mutability.jl test/longsequences/predicates.jl test/longsequences/print.jl test/longsequences/randseq.jl test/longsequences/shuffle.jl test/longsequences/subseq.jl test/longsequences/transformations.jl test/mers/access.jl test/mers/arithmetic.jl test/mers/comparisons.jl test/mers/conversion.jl test/mers/debruijn_neighbors.jl test/mers/find.jl test/mers/length.jl test/mers/mismatches.jl test/mers/order.jl test/mers/print.jl test/mers/random.jl test/mers/shuffle.jl test/mers/transformations.jl test/refseq/basics.jl test/refseq/conversion.jl test/refseq/long.jl test/refseq/print.jl test/refseq/random.jl test/runtests.jl test/search/approximate.jl test/search/exact.jl test/search/pwm.jl test/search/regex.jl test/symbols.jl test/translation.jl <<<<<< network # path=./lcov.info SF:src/BioSequences.jl DA:271,0 LH:0 LF:1 end_of_record SF:src/alphabet.jl DA:34,0 DA:35,0 DA:36,0 DA:37,8221 DA:43,140 DA:44,0 DA:45,0 DA:56,0 DA:57,0 DA:60,130603 DA:64,28000 DA:67,0 DA:68,0 DA:71,0 DA:74,0 DA:82,0 DA:89,0 DA:98,0 DA:102,0 DA:103,0 DA:104,1176 DA:114,0 DA:115,0 DA:116,0 DA:119,440 DA:123,0 DA:134,0 DA:135,0 DA:136,0 DA:139,0 DA:143,0 DA:154,0 DA:155,0 DA:156,0 DA:168,11 DA:171,0 DA:174,0 DA:183,7 DA:186,0 DA:189,0 DA:211,221826 DA:212,8 DA:214,221796 DA:218,15771017 DA:219,4 DA:221,15771001 DA:224,15770993 DA:228,953758 DA:229,2 DA:231,953722 DA:235,49785732 DA:236,2 DA:238,24892847 DA:241,24892815 DA:250,2178873 DA:251,1 DA:253,2178842 DA:257,7448814 DA:258,1 DA:260,7448783 DA:264,7448754 DA:272,4444475 DA:273,0 DA:275,4444475 DA:280,4444258 DA:281,0 DA:283,4444258 DA:287,4444258 DA:302,306 DA:307,0 DA:309,0 DA:325,36609223 DA:330,0 LH:36 LF:73 end_of_record SF:src/biosequence/biosequence.jl DA:23,0 DA:36,0 DA:53,0 DA:56,0 DA:63,168 DA:68,0 DA:71,0 DA:73,0 DA:76,0 LH:1 LF:9 end_of_record SF:src/biosequence/conversion.jl DA:13,80413 DA:17,554 DA:21,75098 DA:25,144290 DA:26,36604923 DA:29,75098 DA:32,12401 DA:34,0 DA:35,0 DA:36,0 DA:37,0 LH:7 LF:11 end_of_record SF:src/biosequence/counting.jl DA:14,5 DA:15,13 DA:16,378 DA:18,13 DA:22,16000 DA:23,16000 DA:24,385460 DA:26,16000 DA:35,18 DA:37,0 DA:39,0 DA:40,0 DA:41,0 DA:43,0 DA:44,2400 DA:45,2400 DA:56,1829 DA:58,0 DA:59,0 DA:61,0 DA:62,0 DA:64,0 DA:65,0 DA:67,3840 DA:68,0 LH:13 LF:25 end_of_record SF:src/biosequence/find.jl DA:11,48 DA:13,53 DA:14,122 DA:15,122 DA:18,10 DA:22,0 DA:23,0 DA:24,0 DA:25,0 DA:28,0 DA:32,0 DA:35,29 DA:37,23 DA:38,59 DA:39,59 DA:42,5 DA:46,0 DA:47,0 DA:48,0 DA:49,0 DA:52,0 DA:55,14 DA:56,14 LH:12 LF:23 end_of_record SF:src/biosequence/indexing.jl DA:21,0 DA:25,0 DA:29,0 DA:33,0 DA:37,0 DA:41,0 DA:58,52532137 DA:75,52532137 DA:79,20 DA:80,14 DA:82,6 DA:90,10 DA:94,4 DA:98,7623064 DA:102,9276 DA:103,4270 DA:104,7623064 DA:114,168 DA:115,0 DA:116,0 DA:118,0 DA:119,25472 DA:120,0 DA:124,309894624 DA:125,154947267 DA:127,60 DA:131,16 DA:132,10 DA:134,6 DA:138,14 DA:139,34 DA:141,10 DA:145,8545865 DA:146,4272923 DA:148,12 DA:152,148380033 DA:153,148379920 DA:157,6563079 DA:158,6562909 DA:162,44 DA:163,16 DA:167,7972130 DA:168,6571 DA:170,7920727 LH:34 LF:44 end_of_record SF:src/biosequence/predicates.jl DA:10,104386 DA:12,104534 DA:13,594183 DA:15,537275 DA:16,537275 DA:19,8636 DA:23,37957 DA:28,91966 DA:30,6 DA:38,90 DA:39,0 DA:40,27 DA:41,5 DA:45,64 DA:46,4 DA:49,28 DA:51,83 DA:53,32 DA:54,18 DA:59,130 DA:62,10 DA:72,48 DA:73,32 DA:74,32 DA:78,12 DA:88,54 DA:89,87 DA:90,87 DA:93,20 DA:96,4 DA:121,0 DA:122,0 DA:123,0 DA:124,0 DA:125,0 DA:126,0 DA:127,0 DA:128,0 DA:129,0 DA:131,0 LH:29 LF:40 end_of_record SF:src/biosequence/printing.jl DA:4,0 DA:5,0 DA:6,0 DA:7,0 DA:12,15 DA:17,0 DA:18,0 DA:21,8533 DA:23,8533 DA:29,202 DA:34,8 DA:36,8 DA:41,15 DA:44,14 DA:47,24 DA:50,2 DA:57,12 DA:58,12 DA:60,4346 DA:64,8692 DA:67,12 DA:70,12 DA:73,0 DA:74,0 DA:80,10 DA:81,2 DA:83,4 DA:84,4 DA:86,0 DA:87,0 DA:90,0 DA:91,0 DA:94,4 DA:95,19 DA:102,0 DA:103,0 DA:104,0 DA:107,0 LH:22 LF:38 end_of_record SF:src/biosequence/transformations.jl DA:14,6 DA:22,4 DA:23,4 DA:25,4 DA:35,12 DA:36,2 DA:40,4 DA:50,2899 DA:51,2897 DA:54,2897 DA:65,4 DA:67,2 DA:68,2 DA:80,22 DA:82,1429 DA:83,1429 DA:93,8 DA:95,4 DA:105,12 DA:106,2 DA:110,4 DA:119,8 DA:122,4 DA:125,2039 DA:126,18 DA:127,0 DA:135,564 DA:144,0 DA:153,0 DA:182,0 DA:183,0 DA:185,0 DA:194,0 DA:197,9 DA:200,9 DA:207,62 LH:29 LF:36 end_of_record SF:src/bit-manipulation/bit-manipulation.jl DA:7,424440 DA:13,1257878 DA:17,0 DA:20,0 DA:24,0 DA:32,430 DA:33,430 DA:34,430 DA:42,2813 DA:46,13112 DA:50,2700 DA:54,12440 DA:58,2700 DA:62,0 DA:66,12440 DA:70,0 DA:75,12440 DA:79,0 DA:80,0 DA:81,0 DA:87,12440 DA:90,60 DA:91,60 DA:92,60 DA:93,60 LH:17 LF:25 end_of_record SF:src/bit-manipulation/bitindex.jl DA:15,7693539 DA:18,0 DA:19,0 DA:22,0 DA:25,0 DA:26,0 DA:27,0 DA:28,0 DA:29,0 DA:31,0 DA:32,0 DA:34,0 DA:35,0 DA:36,0 DA:37,0 DA:38,0 DA:39,0 DA:42,0 DA:46,0 DA:50,7623132 DA:51,0 DA:52,7623132 DA:53,7623132 DA:55,0 DA:59,0 DA:63,0 DA:64,0 DA:65,0 DA:73,74178323 DA:78,0 DA:79,0 DA:80,0 DA:86,0 LH:5 LF:33 end_of_record SF:src/bit-manipulation/bitpar-compiler.jl DA:20,1168 DA:25,1168 DA:29,0 DA:33,1168 DA:35,1168 DA:38,2103 DA:41,2336 DA:43,1140 DA:46,1168 DA:52,0 DA:53,0 DA:54,0 DA:57,0 DA:62,0 DA:63,0 DA:64,0 DA:68,0 DA:69,0 DA:70,0 DA:71,0 DA:72,0 DA:73,0 DA:76,0 DA:77,0 DA:78,0 DA:79,0 DA:80,0 DA:81,0 DA:86,0 DA:87,0 DA:88,0 DA:89,0 DA:90,0 DA:92,0 DA:93,0 DA:94,0 DA:95,0 DA:98,0 DA:125,102564 DA:126,16610 DA:128,34672 DA:145,69344 DA:159,0 DA:175,0 DA:181,0 DA:190,69344 DA:191,139724 DA:198,35190 DA:201,34672 DA:210,34672 DA:212,0 DA:217,0 DA:226,0 DA:229,0 DA:232,0 DA:235,0 DA:243,34672 LH:18 LF:57 end_of_record SF:src/composition.jl DA:17,528 DA:21,213 DA:22,213 DA:23,2290278 DA:26,213 DA:30,1 DA:31,1 DA:32,8 DA:34,2 DA:38,60 DA:39,30 DA:40,30 DA:41,30 DA:42,30 DA:43,30 DA:47,60 DA:48,30 DA:49,30 DA:50,30 DA:51,30 DA:52,30 DA:57,4 DA:58,4 DA:59,68 DA:61,4 DA:65,4 DA:69,2 DA:70,13 DA:72,2 DA:74,80 DA:75,88 DA:83,2 DA:92,440 DA:126,2 DA:127,1 DA:128,18 DA:130,1 DA:134,62 DA:138,0 DA:141,31 DA:142,154 DA:145,1098 DA:149,0 DA:153,60 DA:157,62 DA:158,308 DA:160,31 DA:164,0 DA:165,0 DA:166,0 DA:167,0 DA:168,0 DA:169,0 DA:171,0 DA:176,436 DA:178,218 DA:180,3525 DA:181,4523 DA:184,218 LH:50 LF:59 end_of_record SF:src/demultiplexer.jl DA:12,7 DA:16,14 DA:17,7 DA:18,0 DA:20,7 DA:21,1834 DA:22,1834 DA:26,7 DA:27,7 DA:32,19957 DA:33,19957 DA:34,14791 DA:35,5166 DA:37,4062 DA:40,1841 DA:46,3325 DA:47,19950 DA:55,14137 DA:56,1841 DA:58,3325 DA:60,85997 DA:61,23044 DA:64,3325 DA:68,3325 DA:69,19950 DA:70,3325 DA:74,59850 DA:80,44213 DA:81,44213 DA:83,422424 DA:84,70747 DA:85,280930 DA:86,30152 DA:87,220626 DA:88,70266 DA:89,80094 DA:90,30155 DA:94,422424 DA:96,44000 DA:98,167212 DA:100,44213 DA:101,44213 DA:107,3 DA:117,0 DA:118,0 DA:119,0 DA:120,0 DA:138,6 DA:139,0 DA:140,3 DA:141,0 DA:145,3 DA:146,10 DA:147,10 DA:153,3 DA:157,7 DA:158,22 DA:159,8 DA:161,14 DA:162,14 DA:164,22 DA:165,22 DA:167,7 DA:168,14 DA:171,3 DA:188,80612 DA:191,40204 DA:192,44213 DA:193,44213 DA:194,44213 DA:197,349 DA:199,175 DA:205,174 DA:206,696 DA:207,1184 DA:208,104 DA:209,104 DA:211,0 DA:213,1392 DA:214,892 DA:218,1142 DA:221,348 DA:223,174 DA:227,16 DA:232,214 DA:233,4 DA:236,103 DA:237,524 DA:239,4192 DA:240,4192 DA:241,1304 DA:243,4192 DA:245,2620 DA:248,103 DA:253,8910 DA:254,4358 DA:256,97 DA:259,97 DA:261,97 DA:262,506 DA:265,97 DA:266,2530 DA:267,5060 DA:271,97 DA:272,8878 DA:276,97 DA:277,11980 DA:278,5990 DA:281,97 DA:286,5990 DA:291,5990 DA:292,31599 DA:295,5990 DA:297,34718 DA:298,405164 DA:305,5990 DA:312,104 DA:317,104 DA:318,416 DA:321,104 DA:323,1440 DA:324,12960 DA:332,104 DA:333,520 DA:335,208 DA:336,1544 DA:339,104 LH:119 LF:127 end_of_record SF:src/geneticcode.jl DA:22,1480995 DA:26,0 DA:29,0 DA:30,0 DA:32,0 DA:35,0 DA:36,0 DA:37,0 DA:38,0 DA:39,0 DA:40,0 DA:41,0 DA:42,0 DA:43,0 DA:44,0 DA:45,0 DA:57,361 DA:58,4 DA:61,364 DA:73,0 DA:77,0 DA:80,0 DA:81,0 DA:82,0 DA:83,0 DA:84,0 DA:85,0 DA:86,0 DA:87,0 DA:112,0 DA:113,0 DA:114,0 DA:115,0 DA:116,0 DA:117,0 DA:118,0 DA:119,0 DA:120,0 DA:121,0 DA:122,0 DA:124,0 DA:330,151 DA:334,71 DA:335,71 DA:336,1 DA:339,70 DA:341,2221056 DA:345,3331373 DA:346,123397 DA:347,123397 DA:348,3 DA:351,2 DA:354,246788 DA:357,987062 DA:360,1110458 DA:362,69 DA:365,69 DA:369,4 DA:373,2 DA:380,370189 DA:382,123394 DA:383,123394 DA:384,123394 DA:385,123394 DA:386,370174 DA:387,123390 DA:391,7 DA:392,7 DA:393,508 DA:396,14 DA:397,7 DA:398,14 DA:399,364 DA:403,4 LH:37 LF:74 end_of_record SF:src/iterators/condition.jl DA:8,84 DA:21,56 DA:23,0 DA:24,0 DA:31,56 DA:34,17820 DA:35,28 DA:37,17764 DA:42,8910 DA:43,444206 DA:44,444206 DA:47,28 LH:10 LF:12 end_of_record SF:src/iterators/eachmer.jl DA:33,31850 DA:39,126464 DA:40,126464 DA:42,0 DA:46,0 DA:47,0 DA:48,0 DA:49,0 DA:52,0 DA:53,0 DA:54,0 DA:55,0 DA:56,0 DA:57,0 DA:58,0 DA:64,201 DA:70,392 DA:85,8 DA:88,3 DA:90,5 DA:100,1092 DA:101,0 DA:104,588 DA:105,0 DA:107,588 DA:108,196 DA:112,392 DA:116,0 DA:117,0 DA:118,0 DA:121,336 DA:124,0 DA:125,0 DA:140,2058 DA:142,978 DA:147,936 DA:148,96 DA:150,882 DA:152,72 DA:160,8674 DA:161,32 DA:164,8642 DA:170,8642 DA:181,29484 DA:183,14678 DA:188,14678 DA:190,7186 DA:192,7492 DA:194,64 DA:200,91 DA:205,31162 DA:206,4484 DA:207,15490 DA:211,15490 DA:212,15490 DA:214,9755 DA:216,5735 DA:218,91 DA:223,168 DA:227,45090 DA:228,7455 DA:229,22377 DA:231,22377 DA:234,918 DA:235,918 DA:241,44754 DA:242,92 DA:243,7161 DA:245,15216 DA:247,168 LH:51 LF:70 end_of_record SF:src/iterators/skipmerfactory.jl DA:33,25 DA:39,25 DA:40,0 DA:41,25 DA:42,1 DA:62,24 DA:63,24 DA:65,24 DA:70,0 DA:74,0 DA:77,0 DA:80,0 DA:83,0 DA:85,0 DA:87,0 DA:90,0 DA:91,0 DA:95,36 DA:97,36 DA:101,120 DA:104,36 DA:105,36 DA:107,36 DA:108,600 DA:113,0 DA:117,748 DA:124,374 DA:129,1232 DA:134,1232 DA:136,1232 DA:144,374 DA:145,0 DA:147,0 DA:148,0 DA:150,0 DA:154,374 DA:156,1232 DA:157,1232 DA:159,1232 DA:170,748 DA:175,160 DA:176,6 DA:185,74 DA:191,74 DA:195,80 DA:198,80 DA:204,74 DA:206,74 DA:211,74 DA:214,74 DA:219,6 DA:223,12 DA:224,12 DA:228,160 DA:229,160 DA:230,12 DA:232,148 DA:246,0 LH:42 LF:58 end_of_record SF:src/longsequences/constructors.jl DA:11,267806 DA:12,8 DA:14,133895 DA:17,2 DA:18,2 DA:19,2 DA:20,2 DA:23,0 DA:27,12 DA:31,24531 DA:36,157 DA:37,157 DA:42,24 DA:43,16244 DA:44,16244 DA:51,60 DA:52,20740 DA:58,0 DA:59,0 DA:60,0 DA:61,0 DA:65,40434 DA:66,20217 DA:67,720011 DA:69,20215 DA:73,0 DA:78,0 DA:83,10 DA:88,30481 DA:89,30470 DA:90,62725 DA:92,30481 DA:94,30470 DA:96,62725 DA:98,30481 DA:102,20066 DA:104,20066 DA:106,2019202 DA:108,20066 DA:112,61060 DA:114,40116 DA:117,0 LH:34 LF:42 end_of_record SF:src/longsequences/conversion.jl DA:15,0 DA:22,0 DA:23,0 DA:27,20034 DA:32,0 DA:35,176 LH:2 LF:6 end_of_record SF:src/longsequences/copying.jl DA:30,12 DA:35,20 DA:39,16 DA:42,16 DA:51,2 DA:56,16 DA:81,3297 DA:87,2131573 DA:93,4226956 DA:94,2113478 DA:97,4226956 DA:98,2904 DA:107,13366558 DA:111,4572705 DA:113,1175917 DA:118,4572705 DA:123,4572705 DA:126,2110574 DA:129,160 DA:153,77 DA:158,35 DA:162,70 DA:163,70 DA:167,50 DA:168,99 DA:169,42 DA:189,27813070 DA:195,6 DA:197,36 DA:204,1592287 DA:207,27813052 DA:209,1592287 DA:210,1592284 DA:218,16614 DA:219,16614 DA:221,1578140 DA:223,16612 DA:224,13971 DA:226,16611 DA:238,68 DA:244,30 DA:246,30 DA:247,30 DA:251,151 DA:277,21566 DA:285,120 DA:289,0 DA:296,42797 DA:297,0 DA:301,21565 DA:305,5045228 DA:307,2224445 DA:308,2503885 DA:310,21369 DA:316,270 DA:317,270 DA:324,2764 DA:325,144 DA:329,1112 DA:334,270 DA:340,270 DA:343,173 DA:346,270 LH:61 LF:63 end_of_record SF:src/longsequences/counting.jl DA:22,1747 DA:41,11152 DA:42,4800 DA:51,0 DA:67,10400 DA:68,4800 DA:107,0 DA:108,0 DA:112,2400 DA:113,7200 DA:114,2400 DA:115,2400 DA:134,7200 DA:135,2400 DA:136,2400 DA:145,0 DA:161,7200 DA:162,2400 DA:163,2400 LH:15 LF:19 end_of_record SF:src/longsequences/hash.jl DA:22,0 DA:26,0 DA:27,0 DA:28,0 DA:29,0 DA:30,0 DA:31,0 DA:35,237714 DA:37,237714 DA:43,237714 DA:45,237714 DA:51,0 DA:52,0 DA:53,0 DA:54,0 DA:56,0 DA:57,0 DA:58,0 DA:59,0 DA:61,0 DA:65,0 DA:66,0 DA:67,0 DA:68,0 DA:69,0 DA:70,0 DA:71,0 DA:72,0 DA:74,0 DA:82,58614 DA:84,57503 DA:86,58614 DA:87,8702 DA:89,58614 DA:94,58614 DA:101,58614 DA:106,475428 DA:111,179100 DA:117,58614 LH:14 LF:39 end_of_record SF:src/longsequences/indexing.jl DA:10,48566 DA:11,24275 DA:12,24275 DA:18,16 DA:20,4 DA:26,16 DA:28,4 DA:34,20 DA:36,6 DA:41,4 DA:45,4 DA:53,12 DA:54,7623120 DA:59,12 DA:60,56 DA:62,12 DA:66,4 DA:68,16 DA:69,32 DA:70,16 DA:71,4 DA:73,24 DA:75,4 DA:80,8 DA:81,10 DA:83,4 DA:89,4 DA:90,16 DA:91,32 DA:92,16 DA:93,4 DA:95,24 DA:97,4 DA:106,12 LH:34 LF:34 end_of_record SF:src/longsequences/longsequence.jl DA:44,160182 DA:59,0 DA:60,840 DA:61,1512 DA:62,0 DA:63,1008 DA:66,0 DA:70,0 LH:4 LF:8 end_of_record SF:src/longsequences/operators.jl DA:50,15 DA:51,19 DA:53,13 DA:54,64 DA:56,11 DA:58,23 DA:59,54 DA:61,5 DA:62,6 DA:64,23 DA:65,54 DA:67,5 DA:69,1 DA:118,9 DA:119,9 DA:121,9 DA:122,46 DA:124,9 DA:126,20 DA:127,40 DA:129,4 DA:130,4 DA:132,18 DA:133,38 DA:135,4 DA:137,0 DA:174,0 DA:175,0 DA:176,0 DA:177,0 DA:178,0 DA:179,0 DA:180,0 DA:181,0 DA:182,0 DA:183,0 DA:184,0 DA:185,0 DA:186,0 DA:187,0 DA:189,0 DA:190,0 DA:191,0 DA:192,0 DA:194,0 DA:196,0 LH:25 LF:46 end_of_record SF:src/longsequences/printing.jl DA:5,19 DA:10,2 DA:16,18 DA:17,1 DA:19,8 DA:21,6 DA:25,2 DA:30,3 DA:31,3 DA:33,4300 DA:37,8600 DA:40,3 LH:12 LF:12 end_of_record SF:src/longsequences/randseq.jl DA:28,6 DA:29,17 DA:30,1 DA:32,16 DA:36,22 DA:37,0 DA:38,1061148 DA:39,3 DA:60,18 DA:62,17 DA:64,16 DA:65,2 DA:66,14 DA:67,2 DA:72,26 DA:73,3 DA:77,10 DA:81,6 DA:82,0 DA:87,4056 DA:88,21654 DA:90,6771 DA:92,4056 DA:94,3 DA:112,456 DA:113,225 DA:115,1057163 DA:117,225 DA:119,16 DA:142,1260 DA:145,630 DA:148,265222 DA:151,132611 DA:153,630 DA:155,2 DA:158,217 DA:160,3 DA:164,2 DA:165,3 DA:168,1 DA:169,1 DA:172,6 DA:175,3 DA:176,3 DA:185,2 DA:186,824 DA:194,2 DA:195,422 DA:203,2 DA:204,633 LH:48 LF:50 end_of_record SF:src/longsequences/stringliterals.jl DA:10,2694 DA:24,1262 DA:39,270 DA:54,162 DA:69,10 LH:5 LF:5 end_of_record SF:src/longsequences/transformations.jl DA:12,16752 DA:13,2 DA:15,5560 DA:19,5560 DA:24,1027 DA:27,1027 DA:30,25683 DA:31,12862 DA:34,25724 DA:36,51366 DA:41,2054 DA:42,0 DA:44,4108 DA:48,24 DA:49,121 DA:51,12 DA:59,910 DA:66,842 DA:71,351 DA:73,351 DA:76,0 DA:80,140 DA:81,2221120 DA:84,1110420 DA:86,140 DA:92,350 DA:102,987 DA:104,467 DA:107,24512 DA:109,467 DA:111,987 DA:120,68 DA:122,352 DA:123,204 DA:130,635 DA:131,138968 DA:141,142 DA:142,282 DA:143,208426 DA:145,282 DA:149,144 DA:151,2 DA:155,568 DA:156,278080 DA:158,284 DA:163,64 DA:165,98 DA:167,32 LH:46 LF:48 end_of_record SF:src/mers/conversion.jl DA:12,1502947 DA:13,11509 DA:14,0 DA:16,11509 DA:17,8 DA:21,1492155 DA:22,280142 DA:23,4738352 DA:24,12 DA:25,4738340 DA:26,2 DA:28,9476675 DA:31,2984277 DA:34,3454 DA:35,6066 DA:38,14 DA:40,4 DA:41,4 DA:44,1480640 DA:46,4 DA:47,4 DA:49,0 DA:51,700 DA:52,490 DA:53,220 DA:55,0 LH:23 LF:26 end_of_record SF:src/mers/counting.jl DA:6,0 DA:12,60 DA:16,60 DA:20,60 DA:24,60 DA:28,3840 DA:32,0 LH:5 LF:7 end_of_record SF:src/mers/indexing.jl DA:5,0 DA:6,0 DA:7,0 DA:10,0 DA:14,18 DA:15,3 DA:16,9 DA:17,18 LH:4 LF:8 end_of_record SF:src/mers/mer.jl DA:28,0 DA:29,0 DA:30,0 DA:31,0 DA:32,0 DA:33,0 DA:34,16 DA:35,0 DA:36,0 DA:37,16 DA:42,30 DA:47,34 DA:48,0 DA:49,0 DA:50,0 DA:53,196 DA:54,192 DA:58,196 DA:60,192 DA:64,1971072 DA:68,3744 DA:71,24 DA:72,280 DA:73,0 DA:75,0 DA:82,40 DA:84,1888068 DA:88,51 DA:90,706238 DA:105,8 DA:113,16 DA:115,0 DA:116,0 DA:119,32 DA:120,8 DA:122,24 DA:131,80 DA:132,40 DA:133,27 DA:134,13 DA:135,13 DA:137,0 DA:146,12 DA:147,6 DA:148,5 DA:149,1 DA:150,1 DA:152,0 LH:31 LF:48 end_of_record SF:src/mers/predicates.jl DA:5,0 DA:6,458 DA:7,84 DA:10,0 LH:2 LF:4 end_of_record SF:src/mers/transformations.jl DA:11,3840 DA:20,1920 DA:22,1920 DA:31,3840 DA:43,0 DA:49,42120 DA:51,84240 DA:57,1348 DA:58,1348 DA:59,42120 DA:60,42120 DA:62,1348 LH:11 LF:12 end_of_record SF:src/minhash.jl DA:24,2 DA:25,2 DA:26,2 DA:30,1 DA:31,2 DA:33,0 DA:34,0 DA:37,3 DA:43,2 DA:45,404 DA:47,200 DA:49,200 DA:50,200 DA:54,2 DA:57,1010 DA:59,1008 DA:61,1008 DA:63,362 DA:65,4 DA:66,354 DA:68,1008 DA:73,2 DA:82,6 DA:83,2 DA:85,2 DA:90,0 DA:91,0 DA:92,0 DA:95,0 DA:96,0 DA:100,0 DA:101,0 DA:102,0 DA:104,0 DA:105,0 LH:23 LF:35 end_of_record SF:src/nmask.jl DA:11,102 DA:17,0 DA:20,0 DA:23,102 DA:26,102 DA:28,1247 DA:30,195 DA:32,1052 DA:33,1247 DA:36,102 DA:40,0 DA:41,0 DA:42,0 DA:44,0 DA:47,0 DA:49,0 DA:52,0 DA:53,0 DA:57,0 DA:63,73297 DA:64,8875 DA:66,64422 DA:67,64422 DA:71,0 DA:72,0 DA:74,0 DA:75,0 DA:77,0 DA:78,0 DA:79,0 DA:81,0 DA:85,0 DA:86,0 DA:87,0 DA:89,0 DA:90,0 DA:91,0 DA:92,0 DA:96,0 DA:97,0 DA:101,0 DA:102,0 DA:104,0 DA:105,0 DA:107,0 DA:108,0 DA:109,0 DA:111,0 DA:115,0 DA:116,0 DA:117,0 DA:119,0 DA:120,0 DA:121,0 DA:122,0 DA:126,0 DA:127,0 DA:132,0 DA:133,0 DA:134,0 DA:136,0 DA:139,0 DA:143,0 DA:144,0 DA:145,0 DA:146,0 DA:147,0 DA:149,0 LH:12 LF:68 end_of_record SF:src/refseq/refseq.jl DA:19,110 DA:24,4587 DA:26,0 DA:29,0 DA:33,0 DA:37,0 DA:42,0 DA:46,16 DA:49,16 DA:52,14106 DA:54,9196 DA:55,4388 DA:56,420 DA:57,58 DA:58,304 DA:59,55 DA:60,194 DA:61,60 DA:62,74 DA:63,36 DA:65,1 DA:67,4597 DA:68,4597 DA:70,151 DA:72,30 DA:76,176 DA:77,0 DA:79,88 DA:83,2 DA:84,1 DA:85,100 DA:87,1 DA:91,0 DA:93,0 DA:96,0 DA:102,88 DA:113,4722 DA:118,215851 DA:121,70406 DA:125,70406 DA:127,65800 DA:128,9212 DA:129,4605 DA:131,1 DA:133,70405 DA:134,70405 DA:137,2273 DA:139,174 DA:143,22 DA:144,8 DA:146,0 DA:150,73297 DA:151,4532 DA:154,68765 DA:159,12 DA:161,8 DA:165,0 LH:46 LF:57 end_of_record SF:src/search/approx.jl DA:19,90 DA:20,21 DA:21,21 DA:22,24 DA:24,22 DA:25,2 DA:26,2 DA:27,2 DA:29,0 DA:31,45 DA:32,45 DA:46,49 DA:52,47 DA:53,47 DA:55,47 DA:56,47 DA:57,249 DA:58,100 DA:59,1600 DA:60,3412 DA:64,47 DA:75,34 DA:80,32 DA:91,36 DA:96,33 DA:107,8 DA:112,6 DA:123,8 DA:128,6 DA:132,137 DA:133,0 DA:135,83 DA:136,0 DA:139,55 DA:140,8 DA:144,164 DA:147,47 DA:148,12 DA:152,35 DA:153,35 DA:154,17 DA:156,18 DA:168,94 DA:169,0 DA:174,47 DA:179,117 DA:181,47 DA:182,0 DA:185,360 DA:192,128 DA:193,11 DA:194,117 DA:198,256 DA:199,35 DA:206,186 DA:209,12 DA:214,35 DA:218,35 DA:219,119 DA:224,334 DA:227,90 DA:228,512 DA:229,208 DA:234,208 DA:236,90 DA:240,180 DA:242,35 DA:244,35 LH:63 LF:68 end_of_record SF:src/search/exact.jl DA:57,38 DA:64,40 DA:65,2 DA:69,76 DA:70,10 DA:77,28 DA:80,113 DA:81,152 DA:84,56 DA:86,113 DA:87,152 DA:90,28 DA:94,0 DA:95,0 DA:111,46 DA:116,10 DA:117,22 DA:118,22 DA:119,6 DA:121,16 DA:128,26 DA:134,26 DA:135,5 DA:136,4 DA:138,1 DA:142,114 DA:143,51 DA:145,108 DA:146,39 DA:147,8 DA:149,31 DA:151,23 DA:152,15 DA:153,16 DA:154,3 DA:155,5 DA:156,0 DA:158,8 DA:160,54 DA:161,7 DA:163,36 DA:167,6 DA:182,46 DA:187,10 DA:188,22 DA:189,22 DA:190,6 DA:192,16 DA:197,22 DA:203,22 DA:204,5 DA:205,4 DA:207,1 DA:211,78 DA:212,34 DA:214,70 DA:215,23 DA:216,0 DA:218,23 DA:220,12 DA:221,12 DA:222,0 DA:223,0 DA:224,0 DA:225,0 DA:227,0 DA:229,43 DA:230,6 DA:232,22 DA:236,5 DA:245,8 DA:246,4 LH:63 LF:72 end_of_record SF:src/search/pwm.jl DA:26,28 DA:27,1 DA:29,27 DA:34,15 DA:36,0 DA:39,0 DA:43,2 DA:47,12 DA:48,1 DA:51,4 DA:52,2 DA:54,1 DA:55,1 DA:56,3 DA:58,0 DA:59,0 DA:60,2 DA:61,1 DA:63,18 DA:64,2 DA:65,26 DA:66,35 DA:70,2 DA:74,19 DA:75,0 DA:76,38 DA:78,19 DA:82,0 DA:86,0 DA:90,26 DA:94,31 DA:98,2 DA:102,2 DA:106,2 DA:110,2 DA:114,0 DA:132,7 DA:133,0 DA:136,7 DA:148,18 DA:149,1 DA:150,5 DA:151,1 DA:154,4 DA:188,6 DA:192,0 DA:196,0 DA:200,0 DA:204,12 DA:208,2 DA:212,0 DA:221,6 DA:222,1 DA:224,2 DA:230,7 DA:232,7 DA:234,18 DA:235,54 DA:237,36 DA:238,6 DA:240,18 DA:243,7 DA:252,1 DA:256,1 DA:258,9 DA:260,1 DA:264,11 DA:265,5 DA:272,7 DA:273,0 DA:275,6 DA:280,6 DA:283,4 DA:285,27 DA:286,45 DA:287,22 DA:290,66 DA:292,27 DA:293,27 DA:296,1 DA:300,57 DA:301,2 DA:303,54 DA:307,74 DA:308,2 DA:309,2 DA:310,2 DA:311,2 DA:312,8 DA:313,8 DA:314,56 LH:77 LF:91 end_of_record SF:src/search/re.jl DA:13,114 DA:14,1 DA:16,56 DA:17,56 DA:19,56 DA:20,44 DA:21,12 DA:22,5 DA:23,7 DA:24,6 DA:26,1 DA:31,14 DA:49,2010 DA:55,670 DA:59,1112 DA:62,0 DA:63,0 DA:64,0 DA:65,0 DA:76,122 DA:77,0 DA:83,55 DA:84,110 DA:86,55 DA:90,63 DA:91,211 DA:92,304 DA:93,152 DA:94,152 DA:97,22 DA:98,141 DA:101,38 DA:102,122 DA:105,22 DA:107,12 DA:110,16 DA:112,111 DA:114,14 DA:116,14 DA:117,104 DA:119,4 DA:121,8 DA:122,100 DA:123,26 DA:124,13 DA:125,87 DA:128,12 DA:129,0 DA:130,0 DA:131,0 DA:133,0 DA:134,0 DA:137,4 DA:138,8 DA:139,83 DA:142,4 DA:143,79 DA:144,1 DA:145,78 DA:146,3 DA:147,75 DA:149,150 DA:150,162 DA:152,0 DA:155,59 DA:161,21 DA:162,42 DA:163,21 DA:164,21 DA:165,9 DA:166,9 DA:167,2 DA:170,4 DA:172,7 DA:175,16 DA:177,12 DA:178,5 DA:179,7 DA:180,7 DA:182,0 DA:185,7 DA:186,5 DA:187,0 DA:188,10 DA:189,3 DA:190,2 DA:191,0 DA:193,2 DA:194,0 DA:196,2 DA:199,2 DA:204,0 DA:205,0 DA:211,26 DA:213,4 DA:214,4 DA:218,13 DA:219,39 DA:220,78 DA:221,39 DA:222,78 DA:223,32 DA:224,13 DA:225,13 DA:227,26 DA:230,26 DA:234,7 DA:236,83 DA:237,152 DA:238,76 DA:239,76 DA:240,7 DA:241,7 DA:242,69 DA:243,7 DA:244,7 DA:245,62 DA:247,14 DA:249,14 DA:250,55 DA:252,28 DA:253,27 DA:254,28 DA:255,13 DA:256,3 DA:257,10 DA:258,3 DA:259,14 DA:260,21 DA:262,0 DA:265,7 DA:269,0 DA:271,14 DA:272,28 DA:273,14 DA:274,14 DA:275,7 DA:276,7 DA:277,0 DA:280,0 DA:282,7 DA:285,14 DA:287,7 DA:288,0 DA:289,7 DA:290,7 DA:292,0 DA:295,7 DA:296,0 DA:297,0 DA:299,0 DA:301,7 DA:302,0 DA:304,7 DA:309,14 DA:310,42 DA:311,84 DA:312,42 DA:313,84 DA:314,56 DA:315,14 DA:316,14 DA:317,7 DA:318,7 DA:319,7 DA:321,0 DA:323,28 DA:329,19 DA:330,97 DA:331,97 DA:334,0 DA:337,0 DA:339,0 DA:342,363 DA:344,363 DA:347,54 DA:348,345 DA:351,3 DA:352,344 DA:355,8 DA:356,340 DA:359,2 DA:360,339 DA:362,380 DA:363,179 DA:365,32 DA:366,116 DA:368,16 DA:369,16 DA:370,163 DA:372,22 DA:373,80 DA:375,11 DA:376,11 DA:377,152 DA:378,0 DA:379,304 DA:380,14 DA:381,14 DA:383,14 DA:387,9 DA:388,5 DA:394,6 DA:395,3 DA:396,2 DA:398,1 DA:400,2 DA:405,4 DA:406,2 DA:407,2 DA:409,0 DA:412,10 DA:413,2 DA:414,2 DA:416,3 DA:420,0 DA:423,363 DA:424,363 DA:425,976 DA:427,363 DA:431,374 DA:461,0 DA:462,187 DA:463,92 DA:464,86 DA:465,16 DA:466,0 DA:467,0 DA:468,6 DA:473,0 DA:477,951 DA:481,0 DA:482,0 DA:483,0 DA:484,0 DA:485,0 DA:486,0 DA:487,0 DA:488,0 DA:489,0 DA:490,0 DA:491,0 DA:492,0 DA:493,0 DA:494,0 DA:495,0 DA:496,0 DA:497,0 DA:498,0 DA:500,0 DA:505,0 DA:506,0 DA:507,0 DA:508,0 DA:509,0 DA:515,62 DA:517,62 DA:520,62 DA:524,363 DA:526,363 DA:527,561 DA:528,176 DA:529,116 DA:530,476 DA:532,60 DA:535,30 DA:537,30 DA:538,30 DA:541,3 DA:543,3 DA:544,27 DA:547,13 DA:551,13 DA:552,13 DA:553,14 DA:556,4 DA:557,4 DA:558,10 DA:559,4 DA:560,6 DA:561,6 DA:563,0 DA:565,363 DA:581,124 DA:582,55 DA:583,7 DA:585,0 DA:587,7 DA:589,0 DA:591,62 DA:593,62 DA:594,966 DA:596,124 DA:597,62 DA:611,3 DA:618,60 DA:623,0 DA:624,0 DA:625,0 DA:626,0 DA:628,0 DA:630,0 DA:639,54 DA:649,6 DA:655,0 DA:656,0 DA:661,127 DA:665,209 DA:666,19 DA:672,58 DA:675,114 DA:676,114 DA:677,37 DA:678,30 DA:679,6 DA:682,108 DA:683,216 DA:684,108 DA:685,108 DA:686,39 DA:688,138 DA:689,138 DA:690,13 DA:693,19 DA:697,5 DA:698,4 DA:699,4 DA:700,1 DA:702,9 DA:713,8 DA:718,0 DA:722,0 DA:726,8 DA:730,8 DA:731,16 DA:732,16 DA:738,2 DA:740,21 DA:745,59 DA:746,59 DA:747,21 DA:750,6 DA:751,3 DA:754,42 DA:756,38 DA:759,76 DA:760,8 DA:762,30 DA:763,30 DA:765,8 DA:769,3 DA:770,1 DA:774,117 DA:783,66 DA:788,0 DA:792,313 DA:793,119 DA:798,313 DA:802,0 DA:803,0 DA:804,0 DA:808,114 DA:818,533 DA:820,1043 DA:823,2086 DA:824,419 DA:825,24 DA:829,395 DA:832,254 DA:834,1248 DA:835,69 DA:836,1110 DA:837,161 DA:838,161 DA:839,788 DA:840,3 DA:841,3 DA:842,782 DA:844,269 DA:845,244 DA:846,49 DA:849,17 DA:851,146 DA:852,13 DA:855,11 DA:857,120 DA:858,60 DA:862,107 LH:309 LF:388 end_of_record <<<<<< EOF